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D.B星河纪元3000年左右 人类进入第二次大开发时代， 人造小行星成为主要的生活区域 在星河团中形成了庞大的交通网络和居住星团群， 人造小行星的创制业务成为这个时代可获得最大赢利的项目之一 ，能源的紧缺进一步出现 而土地资源随着人造小行星的出现开始贬值 大开发时代的到来， 使得沉闷逐渐没落的世界变得动荡而充满希望“ 空贼团 "”宇宙牛仔“” 空间猎人“” 雇佣军团“” 银河特快“ ”星球会计“ ”土地铸造师“……各种新生行业纷纷出现。

不婚主义者一旦怀孕，那该怎么办？闵恩树是一个不婚主义者，她是最年轻的团队主管，现在秘密恋爱已经三年，男朋友是另一部门负责人徐之训。徐之训自认为二人已到谈婚论嫁的程度，因此向恩树求了婚。意料之外，求婚被恩树拒绝。沉浸在痛苦中的闵恩树在欢迎会上醉得一塌糊涂，借着酒劲，冲动之下与送她回家的下属职员在过了一晚。恩树恢复清醒后，身体却未如她所愿，产生了一些异常，本以为只是单纯的胃肠不适，却被医生告知是怀孕。

明末，人们迷信修仙炼丹拒绝求医，中医式微。少年医者李子明机缘巧合之下从一本破旧的《本草纲目》中召唤出药灵——冬葵仙子。她恳请世间唯一能和曾经的李时珍一样与药灵对话的李子明帮助药灵们收集因事故四散的《本草纲目》残页，拯救草药精灵们的世界，同时将《本草纲目》中记载的资料流传下来，将中医发扬光大。李子明医者仁心，不忍拒绝，从此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不断成长，收集残页的同时也与药灵们结下深厚羁绊。